Negli Stati Uniti sono stati identificati per lo meno due ceppi distinti del virus della diarrea epidemica suina (PEDV): il prototipo US PEDV ed il ceppo della variante S-INDEL. L'obiettivo di questo studio fu comparare le differenze di patogenicità di entrambi i ceppi nei suinetti neonati mediante infezioni sperimentali.
Per fare questo si utilizzarono 50 suinetti di 5gg di vita negativi al PEDV, che vennero divisi in 5 gruppi di 10 suinetti ognuno e furono inoculati per via orogastrica con 3 ceppi del prototipo US PEDV (IN19338/2013, NC35140/2013 e NC49469/2013), una variante di S-INDEL (IL20697/2014) e mezzo di coltura negativa al virus, rispettivamente, con titoli virali di 104 TCID50/ml, 10 ml per suinetto.
I 3 ceppi del prototipo di PEDV analizzati in questo studio, indipendentemente dal loro clades filogenetico, avevano una patogenicità similare e causarono una patologia enterica grave nei suinetti di 5gg di vita come evidenziarono i segni clinici, l'escrezione fecale del virus e le lesionoi micro e macroscopiche.
Rispetto ai suinetti inoculati con i tre ceppi del prototipo US PEDV, quelli che furono inoculati con la variante S-INDEL ebbero significativamente meno segni clinici, escrezione virale nelle feci, lesioni macroscopiche nell'intestino tenue, cieco e colon, lesioni istopatologiche nell'intestino tenue e colorazione immunoistochimica nell'ileo.
Tuttavia, il prototipo US PEDV e la variante S-INDEL indussero un livello similare di viremia nei soggetti inoculati. Vennero determinate le sequenziazioni del genoma completo del prototipo di PEDV e della variante di S-INDEL, anche se rimane da chiarire la base molecolare delle differenze della virulenza tra questi ceppi di PEDV utilizzando la genetica inversa.
Chen Q, Gauger PC, Stafne MR, Thomas JT, Madson DM, Huang H, Zheng Y, Li G, Zhang J. Pathogenesis comparison between the United States porcine epidemic diarrhea virus prototype and S-INDEL-variant strains in conventional neonatal piglets.J Gen Virol. 2016 Feb 3. doi: 10.1099/jgv.0.000419. [Epub ahead of print]