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Per identificare e caratterizzare l'agente o gli agenti eziologici associati(o associato) con un focolaio di diarrea grave in suinetti in Jiangxi (Cina) nel marzo del 2015, si sviluppò una reazione a catena della polimerasi con trascrizione inversa (RT-PCR) nested per il rilevamento del deltacoronavirus suino (PDCoV).
Uno studio basato sulla nested RT-PCR indicò che la monoinfezione da PDCoV (33,71%) e la coinfezione da PDCoV (19,66%) con il virus della diarrea epidemica suina (PEDV) erano frequenti nelle diarre dei suini in questa regione della Cina. Si osservò una elevata prevalenza da PDCoV (58,33%) in campioni di diarrea che erano PEDV negativi. Fu determinata la sequenza completa del genoma di un ceppo rappresentativo di PDCoV, PDCoV/CHJXNI2/2015. L'analisi filogenetica del genoma completo e la sequenziazione della proteina S del PDCoV/CHJXNI2/2015 dimostró che era molto prossimo al PDCoVs di Hong Kong e degli USA.
A quello che finora noi sappiamo, questo è la prima informativa sulla identificazione, prevalenza, sequenziazione completa del genoma e caratterizzazione molecolare del PDCoV in campioni di diarrea in suini della Cina.
D. Song, et al. Newly Emerged Porcine Deltacoronavirus Associated With Diarrhoea in Swine in China: Identification, Prevalence and Full-Length Genome Sequence Analysis. Transboundary and Emerging Diseases. Volume 62, Issue 6, pages 575–580, December 2015. DOI: 10.1111/tbed.12399
