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Ricercatori di vari centri e università degli USA, Cina e Regno Unito hanno presentato i risultati di uno studio il cui obiettivo era determinare l'origine, l'evoluzione e la genotipizzazione del virus della diarrea epidemica suina (PEDV) che sta colpendo gli allevamenti statunitensi. Lo studio ha caratterizzato le lesioni istologiche di sezioni dell'intestino tenue di suini colpiti e le sequenziazioni genomiche complete di 3 ceppi emergenti di PEDV isolati in focolai del Minnesota e Iowa.
L'analisi genetica e filogenetica dei 3 ceppi statunitensi hanno mostrato una stretta correlazione con i ceppi cinesi del PEDV e la sua probabile origine cinese. I ceppi statunitensi hanno subito divergenze evolutive e si possono classificare in 2 sublinee. I 3 ceppi emergenti degli USA si trovano strettamente correlati con i ceppi isolati nel 2012 nella provincia di Anhui in Cina, il che potrebbe essere il risultato di vari eventi di ricombinazione tra le differenti linee genetiche o sublinee del PEDV. L'analisi dell'orologio molecolare del momento di divergenza basandosi sulla sequenziazione genomica completa è consistente con la differenza del tempo reale, approssimatamente da 2 a 3 anni, tra i focolai di PED in Cina (dicembre 2010) e gli USA (maggio 2013). La scoperta che i ceppi emergenti statunitensi hanno tratti genetici unici nella regione 5' similari ai coronavirus dei pipistrelli, indirizza l'origine evolutiva del PEDV dai pipistrelli e la possibile trasmissione tra specie.
I dati di questo studio hanno importanti implicazioni per la comprensione dei continui focolai di PEDV negli USA e possono servire da guida per sviluppare sistemi di prevenzione efficaci e misure di controllo contro il PEDV.
Yao-Wei Huang, Allan W. Dickerman, Pablo Piñeyro, Long Li, Li Fang, Ross Kiehne, Tanja Opriessnig, Xiang-Jin Meng. Origin, Evolution, and Genotyping of Emergent Porcine Epidemic Diarrhea Virus Strains in the United States. mBio vol. 4 no. 5 e00737-13. http://mbio.asm.org/content/4/5/e00737-13
