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Obiettivo: questo studio mira a studiare le comunità batteriche e la resistenza antimicrobica (AMR) nella polvere aero-dispersa presenti in allevamenti di suini. Polvere aero-dispersa, feci di suino e mangime sono stati raccolti da 9 allevamenti di suini in Tailandia.
Materiali e Metodi: Campioni di polvere aero-dispersa sono stati raccolti dall'aria a favore e contro il capannone dei suini (a distanza di 25 metri ) e all'interno (al centro del capannone) selezionato. Le feci dei suini e i campioni di mangime sono stati raccolti individualmente dal pavimento del box e dalla mangiatoia dello stesso capannone dove veniva raccolta la polvere aero-dispersa. È stata condotta una conta batterica totale diretta su ciascuna piastra di campionamento e ne è stata calcolata la media. Sono stati esaminati i patogeni ESKAPE insieme a Escherichia coli, Salmonella e Streptococco. Sono stati raccolti e analizzati per le MIC un totale di 163 isolati batterici. I batteri raggruppati provenienti dai campioni di polvere sospesa nell'aria sono stati analizzati utilizzando il sequenziamento meta-genomico.
Risultati: La concentrazione batterica più elevata (1,9–11,2 × 103 CFU/m3) è stata riscontrata all'interno degli allevamenti dei suini. Staphylococcus (n = 37) ed Enterococcus (n = 36) erano le specie batteriche più frequenti. Salmonella (n = 3) è stata isolata esclusivamente da mangimi e feci. I batteri bersaglio hanno mostrato una varietà di fenotipi di resistenza e le stesse specie batteriche con lo stesso fenotipo di resistenza sono state trovate nella polvere aero-dispersa, nei mangimi e nelle feci di ciascun allevamento. L'analisi del sequenziamento meta-genomico ha rivelato 1.652 specie batteriche in tutti gli allevamenti di suini, di cui il phylum batterico predominante era Bacillota. Sono stati identificati 159 geni AMR di 12 diverse classi di antibiotici, di cui i geni di resistenza agli aminoglicosidi (24%) erano i più diffusi. Sono stati scoperti un totale di 251 plasmidi diversi e lo stesso plasmide è stato rilevato in più allevamenti.
Conclusione: i risultati fenotipici e metagenomici hanno dimostrato che la polvere aero-dispersa dagli allevamenti di suini conteneva una vasta gamma di specie batteriche e geni che codificavano la resistenza a una serie di agenti antimicrobici clinicamente importanti, indicando il ruolo significativo nella diffusione di agenti patogeni batterici resistenti alla resistenza antimicrobica con potenziali rischi per la salute umana. E' necessario implementare misure specifiche per affrontare la resistenza antimicrobica nelle polveri disperse nell’aria provenienti dagli allevamenti zootecnici.
Metagenomic insights into isolable bacterial communities and antimicrobial resistance in airborne dust from pig farms. Hein Si Thu, Prathan Rangsiya, Srisanga Songsak, Muenhor Dudsadee, Wongsurawat Thidathip, Jenjaroenpun Piroon, Tummaruk Padet, Chuanchuen Rungtip/Front. Vet. Sci., 30 May 2024 Sec. Veterinary Epidemiology and Economics Volume 11 - 2024 | https://doi.org/10.3389/fvets.2024.1362011
