Gli obiettivi di questo studio furono da un lato sviluppare una PCR multiplex in tempo reale per il rilevamento dei genotipi 4 e 5 dell'astrovirus suino (PoAstV) e dall'altra determinare la prevalenza del Torque teno virus (TTSuV1 e TTSuV2), PoAstV4 e PoAstV5 in casi di diarrea.
Durante le ricerche si analizzarono 88 campioni di feci raccolte durante l'anno 2011 che erano stati inviati in forma routinaria al Laboratorio Diagnostico Veterinario dell'Università dell'Iowa State. Tutti i campioni provenivano da differenti allevamenti e da suini di diverse età con uno storico di diarrea. In totale c'erano 13 campioni provenienti da suinetti sottoscrofa, 39 campioni da suinetti svezzati, 16 campioni di suini in accrescimento-ingrasso, mentre di 19 campioni non si sapeva l'età. Si sviluppò una prova di PCR in tempo reale capace di rilevare e differenziare tra 5 gruppi del PoAstV.
La maggior prevalenza si osservò per il PoAstV4 (53,4% dei campioni positivi ), seguito dal TTSuV2 (48,9% positivi), TTSuV1 (31,8% positivi), e PoAstV5 (4,5% positivi). Si identificó una infezione concorrente tra PoAstV4 e TTSuV1 nell'81,2% (13/16) dei campioni ottenuti da suini in accrescimento-ingrasso, nel 23,1% (9/23) dei campioni ottenuti da suini di svezzamento ed un 7,7% (1/13) dai campioni provenienti da suinetti sottoscrofa.
I risultati di questo studio indicano che tanto il TTSuV1 come il PoAstV4 hanno una elevata prevalenza nei campioni di feci di suini con diarrea clinica negli Stati Uniti. In base al limitato numero di campioni, i 2 agenti furono più prevalenti nei suini in accrescimento-ingrasso in comparazione ai suinetti sottoscrofa o in svezzamento. Non si conosce la rilevanza clinica di questi ritrovamenti. Entrambi gli agenti potrebbero incontrarsi casualmente associati con la manifestazione enterica osservata o potrebbero essere trasmessi per via enterica ed il ritrovamento di questi agento nelle feci sarebbe accidentale.
Prevalence of porcine astrovirus and Torque teno sus virus in fecal samples from pigs with diarrhea collected in the United States. T Opriessnig, CT Xiao, PG Halbur. IIPVS, 2012.