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E' stata realizzata la sequenziazione completa del genoma per effettuare comparazioni multiple di 659 S. 4, [5], 12: i: - e 325 S. Typhimurium di differenti fonti ed ubicazioni degli Stati Uniti ed Europa per valutare la loro eterogeneità genetica, focalizzandosi sui ceppi recuperati da suini nel Midwest degli Stati Uniti. Inoltre, è stata individuata la presenza di geni della resistenza ed altri fattori di virulenza ed è stato determinato il fenotipo della resistenza agli antimicrobici in 50 e 22 ceppi isolati, provenienti da animali e persone, rispettivamente.
I ceppi S. 4,5,12: i: - hanno formato due clades principali indipendentemente dalla loro fonte e origine geografica. La maggior parte (84%) dei ceppi isolati negli USA, recuperati dal 2014-2016, inclusi quelli (50/51) recuperati dai suini nel Midwest degli USA, facevano parte di un clade emergente. In questo clade, predominavano i determinanti della resistenza genotipica multipla, inclusa la resistenza contro l'ampicillina, streptomicina, sulfonamidi e tetracicline (ASSuT). La resistenza fenotipica alla enrofloxacin (11/50) e ceftiofur (9/50) venne riscontrata associata con la presenza di geni della resistenza mediata da plasmidi (qnrB19 / qnrB2 / qnrS1 e blaCMY-2 / blaSHV-12, rispettivamente). Inoltre, venne riscontrata una maggior similitudine tra S. 4, [5], 12: i: - del clade emergente e S. Typhimurium dell'Europa che con S. Typhimurium degli USA.
La Salmonella 4, [5], 12: i: che circola attualmente nei suini nel Midwest degli USA, fa parte probabilmente di un clade emergente resistente a molteplici farmaci trovati per la prima volta in Europa, e può trasportare geni della resistenza mediati da plasmidi che possono essere trasmessi orizzontalmente ad altri batteri e pertanto potrebbero rappresentare un problema di sanità pubblica.
Ehud Elnekave, Samuel Hong, Alison E Mather, Dave Boxrud, Angela J Taylor, Victoria Lappi, Timothy J Johnson, Fabio Vannucci, Peter Davies, Craig Hedberg, Andres Perez, Julio Alvarez; Salmonella enterica serotype 4,[5],12:i:- in swine in the United States Midwest: an emerging multidrug resistant clone, Clinical Infectious Diseases, , cix909, https://doi.org/10.1093
