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L'afta è stata eradicata in paesi insulari dell'Asia sud orientale. Brunei, Indonesia e Singapore hanno mantenuto la loro condizione di indenne da afta senza vaccinazione. La zona est della Malesia (Sabah e Sarawak) sono state certificate come indenni da afta senza vaccinazione dall'OIE nel 2004. Nelle Filippine, l'isola di Mindanao ha ottenuto la cerificazione di indenne da afta nel 2000 e le isole di Visayas, Palawan e Masbate nel 2002 mentre le zone 1 e 3 dell'isola filippina di Luzón sono state certificate indenni nel 2010. Nel maggio del 2011, l'OIE ha riconosciuto la zona 2 di Luzón indenne e pertanto tutte le Filippine sono indenni senza vaccinazioni.
I sierotipi O, A e Asia 1 del virus dell'afta sono endemici nei paesi del sudest asiatico continentale (Cambogia, Laos, Malesia, Myanmar, Tailandia e Vietnam), dove si registrano con una certa frequenza focolai d'afta. Il sierotipo O è il più comune e sono stati identificati 3 ceppi ( Asia sudorientale, pan- Asia e Cathay o ceppo adattato ai suini ). Il sierotipo O prototipo adattato ai suini fu segnalato in Vietnam nel 1997 ed in Malesia e Tailandia nel 2005.
Dopo i focolai imponenti alla fine del 1990, dovuto all'incursione del ceppo Pan- Asia del sierotipo O, i focolai cominciarono a diminuire nel 2002. Tuttavia, la ricomparsa del sierotipo A in Tailandia nel 2003 aumentó i focolai in maniera massiccia in quell'anno. Atri focolai furono riscontrati nel 2006, quando il ceppo Myanmar 98 del sierotipo O causó numerosi focolai in Vietnam ed altri paesi .Focolai più recenti furono osservati nuovamente nel 2010/2011.
La scoperta precoce ed il controllo immediato dei focolai è essenziale per prevenire la propagazione dell'infezione, perchè non diventi una epizoozia in piena regola. Questo significa che il 2012-2013 sarà un periodo critico per la campagna di controllo dell'afta.
Il sierotipo A è l'unico che circola attualmente nel continente, nonostante alcune variazioni antigeniche che si sono presentate fin dal 1990, le quali hanno dato luogo alla sostituzione dei ceppi vaccinali.
I ceppi predominanti dell'afta in Cina sono i sierotipi O e Asia 1. Tuttavia, nel 2009, la Cina notificò focolai del sierotipo A che erano similari a quelli che circolavano nella regione del Mekong. Nel 2010 si notificarono anche focolai del ceppo Myanmar 98 del sierotipo O. Un aspetto chiave dela strategia del controllo dell'afta in Cina è la vaccinazione massiccia. Si stima che ogni anno si utilizzano 4.2 miliardi di dosi vaccinali per proteggere 115 milioni di bovini, 652 milioni di suini, 171 milioni di pecore e 196 milioni di capre. La Cina sta studiando proprie opzioni di vaccinazione per far fronte a nuovi ceppi. I recenti focolai di afta in Corea e Giappone causati da virus correlati con il virus che circola nel sudest asiatico, dimostra che anche nei paesi dove esistono servizi veterinari più sviluppati non sono esenti dalle incursioni dell'afta. Paesi indenni dall'afta come l'Oceania devono rimanere vigili ed evitare di far entrare il virus.
La distribuzione e la circolazione del virus dell'afta nelle regioni del sudest asiatico riflette la movimentazione dei capi per motivi commerciali. Esiste una grande disparità nelle varie regioni per guanto riguarda gli investimenti ed i servizi di sanità animale e questo ha un impatto sul controllo dell'afta.
Thanh Long To. Foot-and-Mouth disease in Southeast Asia. The 6th Asian Pig Veterinary Society Congress. 2013.
