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Studio dell'associazione di tutto il genoma per caratteri correlati con la produttività delle scrofe Landrace

Sono stati identificati 5 marcatori indicativi di polimorfismo di un solo nucleotide per il genoma totale...

21 Giugno 2018
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Il miglioramento della produttività della scrofa durante la sua vita produttiva (SLP, per il suo acronimo in inglese, sow lifetime productivity) può aumentare le performance e la redditività dell'azienda. Ci sono geni e fattori ambientali che influenzano questi caratteri complessi. Per identificare i loci dei tratti quantitativi ed i geni candidati posizionali per i tratti relativi alla SLP, è stato condotto uno studio completo sull'associazione genomica (GWAS genome-wide association study) utilizzando 656 scrofe di razza pura Landrace da un allevamento commerciale. Tutte le scrofe della popolazione dello studio sono state genotipizzate con Illumina Porcine SNP60 BeadChip e il GWAS è stato eseguito mediante analisi di associazione lineare basata su modelli a effetti misti che utilizzano il programma GCTA.

Cinque marcatori indicativi di un singolo polimorfismo nucleotidico sono stati identificati per il genoma totale per il totale dei suinetti nati vivi e la parità(N° di parti) finale nella vita produttiva totale. Questi cinque marcatori erano altamente associati con altri caratteri correlati alla SLP, e tutti erano dentro o vicino ad un particolare gene, il MEGF11, sul cromosoma 1.

Questo nuovo gene candidato posizionale potrebbe contribuire ad aumentare la produttività della scrofa per tutta la sua vita produttiva dopo la convalida in altre popolazioni.

J.H.Kang, E.A.Lee, S.H.Lee, S.H.Kim, D.H.Lee, K.C.Hong, H.B.Park. Genome-wide association study for sow lifetime productivity related traits in a Landrace purebred population. Livestock Science. Volume 202, August 2017, Pages 21-24. https://doi.org/10.1016/j.livsci.2017.05.013

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