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La sezione diagnostica di Mantova offre già da anni un supporto all’analisi dei dati di sequenza sui ceppi di PRRSv isolati negli allevamenti italiani. Inoltre, è disponibile e qualificata ad eseguire i seguenti servizi:
- Confronto con i ceppi vaccinali ( Porcilis-Intervet ; Amervac- Hipra)
- Allineamento delle sequenze nucleotidiche e amminoacidiche dello storico aziendale
- Definizione della % d’identità nucleotidica e amminoacidica
E' anche possibile confrontare i ceppi aziendali con quelli di riferimento di PRRSv Tipo 1 (ovvero ceppo europeo) al fine di verificare l’appartenenza ai sottotipi fino ad ora descritti.
Sulla base delle sequenze amminoacidiche di orf 5 si eseguono: analisi dei possibili siti di glicosilazione e analisi delle regioni che, secondo quanto descritto in letteratura, sono riconosciute da anticorpi neutralizzanti.
Inoltre questo servizio è importante per riconoscere la presenza di più virus in un allevamento oppure del cambiamento del virus stesso aziendale nel tempo, potendo così riconoscere l'entrata di nuovi ceppi.
Venerdì, 26 aprile 2013/Italia.IZSLER.Sez. Diagnostica di Mantova
